CentOS環(huán)境準備
在開始安裝LAMMPS之前,需要確保CentOS系統已經更新到最新版本。使用以下命令更新系統:
sudo yum update -y
安裝必要的依賴
LAMMPS的編譯和運行需要一些基本的開發(fā)工具和庫。通過以下命令安裝這些依賴:
sudo yum groupinstall "Development Tools" -y
sudo yum install openmpi openmpi-devel fftw fftw-devel -y
下載LAMMPS源碼
從LAMMPS官方網站下載最新的穩(wěn)定版源碼??梢允褂脀get命令直接下載:
wget https://github.com/lammps/lammps/archive/stable.tar.gz
解壓下載的源碼包:
tar -xzvf stable.tar.gz
編譯LAMMPS
進入解壓后的LAMMPS源碼目錄:
cd lammps-stable/src
使用make命令編譯LAMMPS:
make serial
編譯過程可能需要一些時間,取決于您的系統配置。
配置環(huán)境變量
為了方便使用LAMMPS,可以將編譯生成的可執(zhí)行文件路徑添加到系統的PATH環(huán)境變量中。編輯~/.bashrc文件:
nano ~/.bashrc
在文件末尾添加以下行:
export PATH=$PATH:/path/to/lammps/src
保存并關閉文件,運行以下命令使更改生效:
source ~/.bashrc
驗證安裝
運行以下命令驗證LAMMPS是否成功安裝:
lmp_serial -h
如果顯示LAMMPS的幫助信息,說明安裝成功。
運行LAMMPS示例
LAMMPS源碼包中包含了許多示例文件。可以嘗試運行一個簡單的示例來測試安裝:
cd /path/to/lammps/examples/melt
lmp_serial
結語
至此,您已經在CentOS系統上成功完成了LAMMPS的串行安裝。這個強大的分子動力學模擬工具現在可以用于您的研究和開發(fā)工作。隨著對LAMMPS的深入使用,您可能需要安裝額外的包或啟用特定的功能,可以參考LAMMPS官方文檔獲取更多信息。