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Ubuntu18.04系統(tǒng)如何安裝pdb2pqr
pdb2pqr是一個強大的生物信息學(xué)工具，用于蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析和分子動力學(xué)模擬。本文將指導(dǎo)您在Ubuntu18.04系統(tǒng)上安裝pdb2pqr。
環(huán)境準(zhǔn)備
在安裝pdb2pqr之前，請確保您的Ubuntu18.04系統(tǒng)已更新至最新版本。執(zhí)行以下命令更新系統(tǒng)：
sudo apt update && sudo apt upgrade -y安裝依賴
pdb2pqr需要一些依賴項。通過以下命令安裝必要的軟件包：
sudo apt install python3 python3-pip build-essential cmake下載pdb2pqr源碼
使用git克隆pdb2pqr的源代碼倉庫：
git clone https://github.com/Electrostatics/pdb2pqr.git
cd pdb2pqr編譯安裝
在pdb2pqr目錄中，執(zhí)行以下命令進(jìn)行編譯和安裝：
python3 scons/scons.py
sudo python3 scons/scons.py install配置環(huán)境變量
為方便使用，將pdb2pqr添加到系統(tǒng)路徑。編輯~/.bashrc文件：
echo 'export PATH=$PATH:/usr/local/bin/pdb2pqr' >> ~/.bashrc
source ~/.bashrc驗證安裝
檢查pdb2pqr是否成功安裝：
pdb2pqr --help如果顯示幫助信息，說明安裝成功。
結(jié)語
至此，您已在Ubuntu18.04系統(tǒng)上成功安裝了pdb2pqr?，F(xiàn)在可以開始使用這個強大的工具進(jìn)行蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析和分子動力學(xué)模擬了。如遇問題，請查閱官方文檔或?qū)で笊鐓^(qū)幫助。
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